Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smco2Q9DA21 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms