Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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