Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bpifa3Q9D9J8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bpifa3Q9D9J8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms