Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actrt1Q9D9J3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actrt1Q9D9J3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms