Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4bQ9D9F7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms