Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B7

Prr30, Proline-rich protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr30Q9D9B7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr30Q9D9B7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prr30Q9D9B7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms