Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rexo2Q9D8S4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rexo2Q9D8S4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms