Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms