Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13Q9D777 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13Q9D777 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms