Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufb8Q9D6J5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.8 ms