Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc81Q9D5W4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc81Q9D5W4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms