Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930513O06RikQ9D549 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930513O06RikQ9D549 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms