Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf6Q9D4J7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms