Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf3Q9D4H7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms