Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms