Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clvs1Q9D4C9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms