Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syce1Q9D495 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms