Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UvssaQ9D479 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UvssaQ9D479 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms