Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap53Q9D439 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap53Q9D439 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap53Q9D439 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cfap53Q9D439 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cfap53Q9D439 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms