Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rsph14Q9D3W1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms