Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Pus10Q9D3U0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pus10Q9D3U0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus10Q9D3U0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus10Q9D3U0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pus10Q9D3U0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms