Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy3Q9D394 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms