Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc6bQ9D289 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms