Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1lQ9D1E5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1lQ9D1E5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms