Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm12Q9D0R8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms