Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem88Q9D0N8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem88Q9D0N8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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