Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdca7Q9D0M2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca7Q9D0M2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms