Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms