Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pbdc1Q9D0B6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pbdc1Q9D0B6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pbdc1Q9D0B6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms