Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms