Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp3Q9CZX0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp3Q9CZX0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms