Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrs1Q9CYH6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms