Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms