Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl11Q9CXW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl11Q9CXW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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