Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Sgo1Q9CXH7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms