Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxxc1Q9CWW7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms