Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms