Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx10Q9CWT3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms