Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms