Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a2Q9CTG6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms