Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms