Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gkn2Q9CQS6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Gkn2Q9CQS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms