Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5f1Q9CQQ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms