Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI4

Nwc, Uncharacterized protein C11orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NwcQ9CQI4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NwcQ9CQI4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NwcQ9CQI4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms