Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudt21Q9CQF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms