Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl11Q9CQF0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl11Q9CQF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl11Q9CQF0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms