Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NepnQ9CQ76 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NepnQ9CQ76 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NepnQ9CQ76 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NepnQ9CQ76 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NepnQ9CQ76 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms