Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms