Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd3Q99PL7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scd3Q99PL7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms