Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms